南平市妇女联合会于1995年5月8日—10日，由南平市第一次妇女代表大会选举产生，原名为福建省民主妇女联合会南平专区分会，1957年9月改称福建省妇女联合会南平专区办事处，1969年南平地区搬迁建阳后改名为福建省妇联建阳地区办事处，隶属福建省妇联派出机构。1989年地区搬迁南平，又改名为福建省妇联南平地区办事处。1994撤地设市，1995年5月召开南平市第一次妇女代表大会，2000年5月召开第二次妇女代表大会，2005年12月召开第三次妇女代表大会，2010年12月召开第四次妇女代表大会，2015年12月召开第五次妇女代表大会。目前市妇联内设办公室、组织部、城乡部、宣传部、权益部、儿童部，市妇女儿童工作委员会办公室挂靠市妇联。下设市妇女儿童活动中心、妇女法律咨询服务中心、法律援助中心妇女援助站。